เรือนจำกลางปัตตานี ได้ดำเนินการจัดทำโครงการต่าง ๆ อย่างต่อเนื่อง   เพื่อแก้ไขบำบัดฟื้นฟูผู้ต้องขัง ดังนี้              โครงการโปรแกรมแก้ไขผู้ต้องขังคดีลักษณะความผิดเกี่ยวกับทรัพย์              โครงการแก้ไขผู้ต้องขังคดียาเสพติด (คืนคนดีสู่สังคม)              โครงการแลกเปลี่ยนเรียนรู้คุณธรรมและจริยธรรมอิสลาม ระหว่างผู้ต้องขัง              โครงการถือศีลอด ฝึกจิตใจ ร่วมแก้ไขฟื้นฟู              โครงการแก้ไขฟื้นฟูผู้ต้องขังกระทำผิดซ้ำ              โครงการเตรียมความพร้อมก่อนปล่อย              โครงการเยี่ยมญาติใกล้ชิดตลอดทั้งปี              โครงการจัดทำเครือข่ายราชทัณฑ์ตำบล              โครงการสวัสดิการผู้ต้องขังหญิง       การให้คำปรึกษาเป็นรายกลุ่ม การอบรมศีลธรรมจริยธรรม กิจกรรมครอบครัวสัมพันธ์ การฝึกวิชาชีพทำกรอบรูปไม้ กิจกรรมกลุ่ม กิจกรรมฝึกระเบียบวินัย ฝึกอาชีพซ่อมรถจักรยานยนต์ กิจกรรมกลุ่มสัมพันธ์ กีฬาบำบัด การจัดกิจกรรมจัดการกับ ความเครียด นักเรียนเยี่ยมคุก เยี่ยมญาติใกล้ชิด การฝึกอบรมยุวกาชาด การให้ความรู้ในด้านต่าง ๆ