เรือนจำกลางปัตตานี เป็นราชการบริหารส่วนกลาง สังกัดกรมราชทัณฑ์ กระทรวงยุติธรรม เดิมตั้งอยู่เชิงสะพาน
เดชานุชิต ถนนพิพิธ ตำบลอาเนาะรู อำเภอเมือง
จังหวัดปัตตานี
ต่อมา เนื่องจากชุมชนในเขตเทศบาลเมืองได้ขยายตัว
อย่างรวดเร็ว กระทรวงมหาดไทยในสมัยนั้นได้พิจารณา
เห็นว่าบริเวณที่ตั้งของเรือนจำไม่เหมาะสม จึงได้มีนโยบาย
ให้กรมราชทัณฑ์ดำเนินการสร้างเรือนจำขึ้นใหม่ และได้ย้าย
มาอยู่ ที่ถนนเกษมสำราญ หรือถนนนาเกลือเดิม เมื่อวันที่ 1
มีนาคม 2508 เป็นต้นมา
เมื่อวันที่ 19 ตุลาคม 2547 คณะรัฐมนตรีได้มีมติอนุมัติ
ให้ยกฐานะเรือนจำจังหวัดปัตตานี เป็นเรือนจำกลางปัตตานี
และ เรือนจำพิเศษปัตตานี เพื่อให้มีสถานะเป็นราชการ
บริหารส่วนกลาง
เรือนจำกลางปัตตานีมีขนาดพื้นที่ 109 ไร่ 89 ตารางวา โดยแบ่งแบ่งเป็นพื้นที่ภายในเรือนจำ 12 ไร่
16 ตารางวา ประกอบด้วยเรือนนอนชาย 4 หลัง เรือนนอนหญิง 1 หลัง พื้นที่ภายนอกประกอบด้วยบ้านพัก
ข้าราชการ 29 หลัง อาคารที่ทำการ 1 หลัง อาคารเยี่ยมญาติ 1 หลัง