เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี   ตั้งขึ้นตามเขตอำนาจศาลจังหวัดอุทัยธานีมีอำนาจในการควบคุมผู้ต้องขัง
ที่มีกำหนดโทษจำคุกผู้ต้องขังชายไม่เกิน 15  ปี  ผู้ต้องขังหญิงไม่เกิน 10  ปี  โดยมีหน้าที่ความรับผิดชอบ  ดังนี้      
         -  ปฏิบัติต่อผู้กระทำความผิดให้เป็นไปตามคำพิพากษาหรือคำสั่งตามกฎหมาย  โดยดำเนินการตามกฎหมาย
ว่าด้วย การราชทัณฑ์  และกฎหมายอื่นที่เกี่ยวข้อง
         -  กำหนดแนวทางปฏิบัติต่อผู้ต้องขังโดยให้สอดคล้องกับกฎหมาย  ระเบียบ  ข้อบังคับ  นโยบายของ
กระทรวงยุติธรรม  นโยบายของกรมราชทัณฑ์  หลักอาชญาวิทยา  และหลักทัณฑวิทยาตลอดจนข้อกำหนดมาตรฐาน
ขั้นต่ำสำหรับปฏิบัติต่อผู้ต้องขัง  และข้อเสนอแนะในเรื่องที่เกี่ยวข้องขององค์กรสหประชาชาติ
         -  ดำเนินการเกี่ยวกับสวัสดิการและการสงเคราะห์แก่ผู้ต้องขัง
         -  ปฏิบัติการอื่นใดตามที่กฎหมายกำหนดให้เป็นอำนาจหน้าที่ของเรือนจำหรือที่กรมราชทัณฑ์มอบหมาย

                 เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  ได้แบ่งโครงสร้างการบริหารงานออกเป็น  7  ฝ่าย  ดังนี้
             1. ฝ่ายบริหารทั่วไป
             2. ฝ่ายทัณฑปฏิบัติ
             3. ฝ่ายการศึกษาและพัฒนาจิตใจ
             4. ฝ่ายฝึกวิชาชีพ
             5. ฝ่ายควบคุมและรักษาการณ์
             6. ฝ่ายสวัสดิการผู้ต้องขัง
             7. สถานพยาบาลเรือนจำ
              - เรือนจำชั่วคราวดอนบ่อกรุ  สังกัด เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  กรมราชทัณฑ์  กระทรวงยุติธรรม
             - สถานกักขังจังหวัดอุทัยธานี
             - สถานที่เพื่อการควบคุมตัวและสถานที่เพื่อรอการตรวจพิสูจน์จังหวัดอุทัยธานี

               ภูมิประเทศ  ขนาดพื้นที่  สถานที่ตั้งและระบบความมั่นคงของเรือนจำ
          -  เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  ตั้งอยู่เลขที่ 23 ถนนศรีอุทัย ตำบลอุทัยใหม่ อำเภอเมือง จังหวัดอุทัยธานี
                  ทิศเหนือติดกับสถานีตำรวจภูธรอำเภอเมืองอุทัยธานี 
                  ทิศใต้ติดจวนผู้ว่าราชการจังหวัดอุทัยธานี
                   ทิศตะวันออกติดถนนศรีอุทัย
                  ทิศตะวันตกติดถนนอุทัยธานี - มโนรมย์  
          -  เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  มีขนาดพื้นที่ภายในเรือนจำฯ  4 - 2 - 00  ไร่ พื้นที่ภายนอกเรือนจำฯ 4 - 0 - 00  ไร่  ซึ่งเป็นบริเวณบ้านพักเจ้าหน้าที่  และบริเวณรอบกำแพงด้านนอก  รวมพื้นที่  8 - 2 - 00 ไร่
          -  บริเวณเรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  แบ่งเป็น  2  แดน  คือ  แดนผู้ต้องขังชาย  และแดนผู้ต้องขังหญิง
                  มีอาคารเรือนนอนผู้ต้องขังชาย  2  หลัง
                  มีอาคารเรือนนอนผู้ต้องขังหญิง  1  หลัง 
                  มีโรงงานฝึกวิชาชีพ  5  หลัง 
                  มีสถานพยาบาล  1  หลัง 
                  สถานกักขังและสถานที่เพื่อการควบคุมตัวและสถานที่เพื่อการตรวจพิสูจน์  จำนวน  1  หลัง
          -  เรือนจำจังหวัดอุทัยธานี  มีที่ดินอยู่ในความครองครองดูแลเพื่อจัดตั้งเป็นเรือนจำชั่วคราว 1  แห่ง  คือ
เรือนจำชั่วคราว  “ดอนบ่อกรุ”  ตั้งอยู่ที่  ตำบลท่าโพ  อำเภอหนองขาหย่าง  จังหวัดอุทัยธานี  มีเนื้อที่  39  ไร่
ซึ่งกระทรวงมหาดไทยได้อนุมัติให้ใช้แล้ว  และอยู่ระหว่างการขออนุมัติใช้เพิ่มเติมอีก  15  ไร่  รวมเป็น  54  ไร่ 

              -  ระบบความมั่นคงของเรือนจำฯ  มีกำแพงคอนกรีตเสริมเหล็กสูง  5  เมตร  และเสริมด้วยลวดหนาม
          -  บริเวณรอบแนวกำแพงติดตั้งระบบสายไฟแรงสูงขนาด  3,500  โวลต์ 
          -  บริเวณภายในเรือนจำฯ  แบ่งเป็นสัดส่วนโดยมีรั้วลวดหนามแบ่งกั้นแต่และแดน และกั้นแดนบริเวณ
โรงงานฝึกวิชาชีพให้เป็นสัดส่วน             
          -  มีการติดตั้งระบบโทรทัศน์วงจรปิดบริเวณต่างๆ  โดยมีจอแสดงภาพอยู่ที่ทำการฝ่ายควบคุมและรักษาการณ์