1. ฝ่ายบริหารทั่วไป
ดำเนินการเกี่ยวกับเงินงบประมาณและนอกงบประมาณ งานสารบรรณ งานทะเบียนเอกสาร ที่สำคัญ การเงินการบัญชี การพัสดุ อาคารสถานที่ ยานพาหนะ การบริหารงานบุคคล การประชาสัมพันธ์ งานรับเรื่องราวร้องทุกข์ งานเลขานุการ งานการประชุม การรวบรวมสถิติข้อมูลต่างๆ งานแผนงานและโครงการ การติดตามประเมินผล รวมทั้งงานบริการและงานที่มิได้กำหนดให้เป็นหน้าที่ของฝ่ายใดฝ่ายหนึ่งโดยเฉพาะ แบ่งการบริหารภายใน เป็น 5 งาน ดังนี้
1. งานธุรการ
2. งานการเจ้าหน้าที่
3. งานการเงินและบัญชี
4. งานพัสดุงบประมาณ
5. งานศูนย์ข้อมูล

2. ฝ่ายปกครองผู้ต้องขัง
มีหน้าที่เกี่ยวกับการวางแผนและการดำเนินการด้านการควบคุมผู้ต้องขังให้อยู่ในกฎระเบียบของทัณฑสถาน แนะนำอบรมเกี่ยวกับระเบียบวินัยและการปฏิบัติตนในทัณฑสถานแก่ผู้ต้องขัง

3. ฝ่ายรักษาการณ์
มีหน้าที่การรักษาการณ์บริเวณภายในและภายนอกทัณฑสถาน การตรวจค้นตัวบุคคลและยานพาหนะเพื่อป้องกันการลักลอบนำสิ่งของต้องห้ามและผิดกฎหมายเข้าภายในทัณฑสถาน

4. ฝ่ายทัณฑปฏิบัติ
ดำเนินการเกี่ยวกับการตรวจสอบหมายศาล การรับตัว การปล่อยตัว การจัดทำทะเบียนประวัติ การจำแนกลักษณะผู้ต้องขัง การเลื่อนชั้น การลดชั้น การย้ายผู้ต้องขัง ผู้ต้องขังถึงแก่กรรม การออกใบบริสุทธิ์ การลดวันต้องโทษจำคุก การขอพระราชทานอภัยโทษ การพักการลงโทษ และ การดำเนินการเกี่ยวกับการส่งผู้ต้องขังออกทำงานภายนอกทัณฑสถาน แบ่งการบริหารภายในเป็น 4 งาน ดังนี้
1. งานทัณฑปฏิบัติ
2. งานทะเบียนประวัติผู้ต้องขัง
3.งานจำแนกลักษณะผู้ต้องขัง
4. งานพักการลงโทษและลดวันต้องโทษ
5.งานวินัยผู้ต้องขัง

5. ฝ่ายสวัสดิการและสงเคราะห์ผู้ต้องขัง
ดำเนินการเกี่ยวกับงานสวัสดิการผู้ต้องขัง งานสูทกรรม งานเงินฝากผู้ต้องขัง รวมทั้งการดำเนินการให้ผู้ต้องขังได้รับการเยี่ยมญาติภายใต้ข้อบังคับ กฎระเบียบของกรมราชทัณฑ์เนินงานเกี่ยวกับการสงเคราะห์ผู้ต้องขังและครอบครัว การจัดร้านสวัสดิการจำหน่ายสินค้าแก่ผู้ต้องขัง และโครงการกำลังใจในพระดำริพระเจ้าหลานเธอ พระองค์เจ้าพัชรกิติยาภา แบ่งการบริหารงานภายใน ดังนี้
1. งานสวัสดิการผู้ต้องขัง
2. งานสูทกรรม
3. งานเงินฝากผู้ต้องขัง
4. งานญาติเยี่ยม
5. งานสงเคราะห์ผู้ต้องขัง
6. งานร้านสงเคราะห์ผู้ต้องขัง
7. งานโครงการกำลังใจในพระดำริพระเจ้าหลานเธอ พระองค์เจ้าพัชรกิติยาภา

ุุ6. ฝ่ายฝึกวิชาชีพ
มีหน้าที่วางแผนและดำเนินการฝึกวิชาชีพแก่ผู้ต้องขัง ให้สอดคล้องกับวัตถุดิบที่มีอยู่ในพื้นที่ตามความต้องการของตลาดและความถนัดของผู้ต้องขัง พัฒนาทักษะด้านการฝึกวิชาชีพประเภทต่าง ๆ ของผู้ต้องขัง เตรียมความพร้อมด้านวิชาชีพให้ผู้ต้องขังใกล้พ้นโทษ การจัดหาวัตถุดิบ การตลาด และการจัดจำหน่ายผลิตภัณฑ์ การบริหารเงินทุนผลประโยชน์จากการฝึกวิชาชีพ ควบคุมการใช้ยานพาหนะที่จัดซื้อด้วยเงินทุนฝึกวิชาชีพ แบ่งการบริหารภายในเป็น 4 งาน ดังนี้
1. งานฝึกวิชาชีพ
2. งานเงินทุนผลพลอยได้
3. งานพัสดุเงินผลพลอยได้
4. งานพาณิชย์เงินผลพลอยได้

7. ฝ่ายการศึกษาและพัฒนาจิตใจ
ดำเนินการจัดการศึกษาวิชาสามัญได้เปิดสอนตั้งแต่ไม่รู้หนังสือจนถึงระดับปริญญาตรี (มสธ.) สายอาชีพเปิดสอนตามความต้องการของตลาดแรงงานและความสมัครใจของผู้เรียน ซึ่งได้เปิดสอนหลายสาขา สำหรับธรรมศึกษามีการอบรมและพัฒนาจิตใจผู้ต้องขัง แนะนำอบรมเกี่ยวกับระเบียบวินัย และการปฏิบัติตัวแก่ผู้ต้องขัง จัดกิจกรรมเพื่อสนับสนุน ส่งเสริม ปลูกฝัง ปรับเปลี่ยนทัศนคติ จิตสำนึก ค่านิยม และพฤติกรรมของผู้ต้องขังให้เป็นไปในทางที่ดี จัดกิจกรรมเสริมการศึกษา เช่น ห้องสมุด การจัดหาโสตทัศนูปกรณ์ การศึกษาทางไกล เป็นต้น แบ่งการบริหารภายในฝ่าย ดังนี้
- งานการศึกษาสายสามัญ
- งานการศึกษาสายอาชีพ
- งานการศึกษาสายธรรมศึกษา
- งานชุมชนบำบัด

8. สถานพยาบาล
มีหน้าที่ความรับผิดชอบในการให้การบำบัดรักษาผู้ต้องขังที่เจ็บป่วย ผู้ต้องขังตั้งครรภ์ คนชราและเด็ก ตลอดจนการสงเคราะห์ในด้านการรักษาพยาบาลภายในและภายนอก ทัณฑสถาน แบ่งการบริหารงานภายในเป็น 4งาน ดังนี้
1. งานส่งเสริมสุขภาพ
2. งานป้องกันและควบคุมโรค
3. งานรักษาพยาบาล
4. งานฟื้นฟูสมรรถภาพ